Obory navazujícího magisterského studia (od 2012/13):
- Inženýrství pevných látek
- Diagnostika materiálů
- Laserová technika a elektronika
- Optika a nanostruktury
- Informatická fyzika
- Fyzika a technika termojaderné fúze
- Jaderné inženýrství
- Dozimetrie a aplikace ionizujícího záření
- Experimentální jaderná a částicová fyzika
- Matematická informatika
- Aplikace softwarového inženýrství
- Jaderná chemie
- Matematické inženýrství
- Aplikované matematicko-stochastické metody
- Matematická fyzika
- Radiologická fyzika